Скончыў Казанскі медыцынскі інстытут. З 1922 па 1941 г. працаваў урачом у хірургічным аддзяленні Полацкай гарадской бальніцы, сумяшчаў з пасадай судзебна-медыцынскага эксперта і патолагаанатама. Памёр у 1944 г.
Фатаграфію Міхаіла Паўлавіча Мышкіна перадала ў музей у 1986 г. дачка Таццяна Міхайлаўна Мышкіна.